北京大學口腔醫(yī)學院是全國重點高等院校附屬三級甲等專科醫(yī)院，實行口腔醫(yī)院、口腔醫(yī)學院、口腔醫(yī)學研究所三位一體的管理體制，系國家級口腔醫(yī)學中心。

2001年,為緩解人民群眾看牙病難及配合北京市的申奧工作,北京大學口腔醫(yī)院在北京市奧運村中心地區(qū)設(shè)立了第二門診部，法人代表為俞光巖院長，性質(zhì)為國有非營利性，執(zhí)行與北京大學口腔醫(yī)院統(tǒng)一的醫(yī)療質(zhì)量管理制度和收費標準，為北京市基本醫(yī)療保險定點專科醫(yī)療機構(gòu)。

北京大學口腔醫(yī)院第二門診部現(xiàn)有各級專家和醫(yī)師51人，護技69人，行政及輔助人員20人，診療場所面積2000平方米，42臺口腔綜合治療椅。設(shè)有口腔正畸科、修復(fù)科、牙周科、牙體牙髓科、口腔綜合治療科、牙種植門診等臨床科室，除了開展洗牙、補牙、拔牙、牙齒矯正、鑲牙等常規(guī)治療外，還開展牙種植、隱形舌側(cè)正畸、全瓷冠修復(fù)等與國際接軌的先進治療項目。作為北京大學-香港大學牙周專業(yè)臨床培訓中心，第二門診部在牙周病診治領(lǐng)域具有豐富的經(jīng)驗和較強的技術(shù)支持。第二門診部成立7年來共診療30余萬人次，無一例醫(yī)療事故，現(xiàn)日均門診量300人次。

北京大學口腔醫(yī)院第二門診部可以電話預(yù)約看牙時間，無須早起排隊掛號，開診時間為早8：00－晚6：00，周六、日全天門診，適合不愿因為看牙耽誤上班和孩子學習的居民。

北京大學口腔醫(yī)院第二門診部承諾執(zhí)行最嚴格的消毒管理措施，確保一人一機，杜絕乙肝，愛滋病等傳染性疾病交叉感染的可能。