首都醫科大學附屬北京友誼醫院原名為北京蘇聯紅十字醫院，始建于1952年。是新中國成立后，在蘇聯政府和蘇聯紅十字會援助下，由中國政府建立的第一所大醫院。1954年，醫院從甘水橋舊址遷入現址。毛澤東主席、劉少奇副主席、周恩來總理、朱德委員長特為醫院親筆題詞。1957年3月，蘇聯政府將醫院正式移交中國，周總理親自來院參加了移交儀式。1970年，周總理親自為醫院定名為“北京友誼醫院”。
　　醫院占地面積9.4萬余平方米，建筑面積19.4萬平方米。全院現有職工2800余人，其中具有正副主任醫師、正副教授、研究員及相應職稱的高級技術人員近400人。醫院設有臨床及醫技科室43個。日門診量8000人次左右，年出院5萬人次左右。現有編制床位1256張。醫院是首批北京市基本醫療保險A類定點醫療機構，全市患者均可來院參保就醫，并能夠為外賓和來自全國各地的患者提供服務。2009年8月正式啟用的醫療保健中心是集門、急診、住院、檢查于一體的醫療保健服務中心，配有國內最先進的醫療設備和信息系統，承擔著北京市及中央司局級以上8000多名醫照人員、保健對象的醫療保健任務。
　　醫院設有北京市臨床醫學研究所、北京熱帶醫學研究所、北京市中西醫結合研究所和北京市衛生局泌尿外科研究所，擁有一批學科帶頭人和技術骨干。胃腸肝膽胰疾病診治、泌尿系統疾病診治和腎移植、熱帶病和寄生蟲病診治以及中西醫結合是醫院的四大專業特色。內科學（消化系病）、影像與核醫學兩個學科是國家重點（培育）學科；消化內科、臨床護理、地方病（熱帶醫學）、普通外科、重癥醫學科獲批國家臨床重點專科。醫院還被確定為北京市消化內鏡質量控制和改進中心、北京市護理質量控制和改進中心、北京市重癥醫學質量控制和改進中心以及北京市麻醉質量控制和改進中心。在保持綜合優勢的基礎上，醫院突出特色，打造優勢學科群。在北京市衛生系統率先成立了跨學科、跨專業的疑難病綜合會診中心；發揮強強聯合優勢，成立了以消化內科、普外科、肝病中心為龍頭的北京市消化疾病中心，在診治消化急危疑難重癥方面處于國內領先水平；成立了心血管內、外科合并模式的心血管疾病診治研究中心，開辟了挽救急性心肌梗塞患者生命的綠色通道。
　　醫院承擔了九五、十五、十一五攻關（支撐）課題、973、863、國家自然科學基金、衛生部公益性項目和市級課題，并擔負著世界衛生組織在寄生蟲、麻風病等方面課題的研究工作。近20年來，先后獲國家級、部級、市級、局級科研成果獎400余項。
　　醫院是首都醫科大學第二臨床醫學院，是培養高層次醫學人才的臨床教學基地。首都醫科大學消化病學系、腎病學系、泌尿外科學系、中西醫結合學系和普通外科學系等5個學系掛靠醫院，承擔著本專科生、研究生、住院醫師培訓及全員繼續教育、成人學歷教育任務。擁有15個衛生部認可的住院醫普通專科培訓基地、9個亞專科培訓基地。是國家執業醫師資格技能考試基地，北京市社區護士和全科醫生技能考試基地，是北京市三個臨床技能中心掛靠單位，承擔著衛生局住院醫師規范化培訓階段考核任務，承辦多項國家級繼續教育和師資培訓項目。目前擁有碩士培養點32個、博士培養點15個，現有研究生導師90余名；教授、副教授近140名。有多名教授在國際醫學專業學會任職，有20余名教授在中華醫學會各專業學會、北京分會以及國家級雜志擔任副主委以上職務。
　　醫院積極開展多渠道、多領域的國際交流合作。先后與美國、日本、韓國、丹麥、俄羅斯等國家和地區的醫療機構建立了友好合作關系，派出各專業人員出國深造。設立李桓英基金會資助青年骨干出國研修項目，促進了醫院學術水平的提高。
　　醫院曾被授予全國先進基層黨組織、全國“三八”紅旗集體、全國模范職工之家、多次被授予首都文明單位標兵等光榮稱號。
　　醫院成立60年來，得到了各級領導的支持鼓勵與悉心指導，也牢記著黨中央和老百姓的殷切希望與盈盈囑托。幾代友誼人實踐著“仁愛博精”的友誼精神，不斷開拓創新，奮力拼搏。2011年4月25日，中共中央政治局常委、國務院副總理李克強來到醫院視察和調研醫改工作，對醫務人員積極投身醫改的做法給予了充分肯定，對醫務人員無私的奉獻精神給予了高度評價，并做出重要指示，宣布友誼醫院為全國及北京市的公立醫院試點改革重點、試點單位。在推進和深化醫療體制改革的進程中，今天的友誼人將以更高的起點和嶄新的精神風貌，團結協作，與時俱進，勇于擔當，繼續前行，以高超的醫術和無私的愛心，努力攀登醫學科學高峰，逐步向“綜合優勢明顯，專科特色突出，國內一流、國際知名的大學醫院”的目標邁進，開創北京友誼醫院更加美好的未來，為首都醫藥衛生事業的發展做出新的更大貢獻！