吉大二院民康醫院的前身是長春市南關區醫院。第一門診部位于長春市亞泰大街1085號，第二門診及住院部位于平陽街16號。總建設面積為15000平方米。
吉大二院民康醫院是十六屆三中全會后，為了適應我國醫療事業改革的新形勢，探索國有二級醫院在嚴峻的醫療市場競爭中如何生存發展的新路子。南關區委、區人民政府與吉林大學第二醫院經過充分醞釀，取得共識，于2003年9月組建。經過10月、11月兩個月的試運行，定于12月19日正式開業。
　　吉大二院民康醫院組建后，吉大二院派出管理人員和技術骨干與原南關區醫院的管理、技術人員共同管理該院，保證醫療、護理及各項日常工作的正常運行，在較短時間內，使醫院的形勢好轉，并適時轉入股份制改造。
　　吉大二院民康醫院設有綜合內科、綜合外科（含骨科）、神經內科、婦產科、中醫科、眼科、口腔科、耳鼻喉科、康復科、骨質增生、泌尿病專科等十余個臨床科室。
　　吉大二院民康醫院現有全身CT機，500毫安可視X光機、彩超、B超、全自動生化分析儀、動態心電儀、床旁監護儀、母嬰監護、新生兒搶救臺等大型醫療設備，滿足了臨床工作的需要。股份制改后，醫院的形勢發生了變化，病人逐漸增多，收入明顯增加，職工信心倍增。有政府和上級主管部門的正確領導和支持，依托吉大二院雄厚的技術力量及先進的管理模式，乘著醫療事業改革的東風，民康醫院這一新生事物，一定會在改革的浪潮中乘風破浪、勇往直前，為南關區的父老兄弟姐妹和廣大的人民群眾的健康做出更大的貢獻。