縱隔子宮是先天性的，是子宮發育異常的一種狀態，即子宮先天腔化不全。是因為在胚胎期兩側副中腎管融合不全，在宮腔形成縱隔。從子宮底、宮頸內口將宮腔分隔成兩個部分，完全分隔就是完全縱隔子宮，部分隔開就是不完全縱隔子宮。它可能會對懷孕造成影響的。
不全縱隔子宮可能會導致不孕、流產、異位妊娠等。因為子宮不完全縱隔不利于受精卵的著床。另外，由于子宮畸形，也容易導致異位妊娠。但不是胚胎停育就一定是不全縱隔子宮引起的。
子宮縱隔是否會導致胎停育，需根據子宮縱隔的類型進行分析。
不完全縱隔是從宮底開始有畸形縱隔，就像房間里砌了一堵隔墻，但是縱隔并未達到宮頸部位，也就是隔墻沒有把整個房間隔起來，有時不到一半的位置。但由于宮腔形態不規整，有縱隔擋著，易導致胚囊在比較低的位置著床，引起前置胎盤，有可能不會導致胎停育。B超檢查提示受精卵在宮腔內，無論在左側還是右側，只要懷孕時子宮肌壁發育良好，子宮肌壁不薄弱，一般可以順利完成整個妊娠過程。
完全縱隔：完全子宮縱隔可將宮腔分為兩個部分，也就是房間被一堵墻完全隔離開了，因此宮腔容積較小，受精卵不易著床或著床后可引起宮縮，可能導致胎停育、流產、早產、胎兒宮內發育遲緩等情況。
是否由于縱隔子宮導致的胎停育，還需要結合子宮縱隔的大小、寬度等具體情況進行綜合評估。若屬于完全子宮縱隔，第一次妊娠失敗后，建議在恢復月經后進行子宮縱隔切除術，避免再次出現子宮縱隔造成的不孕、流產、異位妊娠、異常分娩等情況。